被松绑之后，犹豫了一下，但是最终也没有说话，扭头跟着近卫走出了帅府，而肖天健转身过来下令，为战死在定淮门内的孙应元收殓遗体，在南京城外择地厚葬，肖天健历来对这样的忠臣都是尊重的，虽说孙应元率部杀伤了不少刑天军的部众，可是他也赢得了刑天军上下的一致尊重，在彦书亭攻入城中之后，彦书亭便已经先行将他的尸体收殓了起来，派人找了一个上好的棺木，将他收殓了起来，抬出了内城，现如今总算是被肖天健派人安葬了。

    肖天健为此还亲自提笔，为他题写了墓碑，也算是让孙应元九泉之下可以瞑目了。

    接着肖天健变得知城中战事全部结束，所有城中官军既没有可能继续抵抗，也没有逃走的可能，于是只得都放下了武器，向刑天军缴械投降，就连城中的皇宫，这个时候也被刑天军控制，于是肖天健便领兵进入到了南京内城之中。